Pokémon UNITE sauvegarde automatiquement votre progression à intervalles réguliers. Il n'est donc pas nécessaire de le faire manuellement.
Néanmoins, pour pouvoir récupérer vos données de sauvegarde de jeu, votre compte Pokémon UNITE doit être lié à une plateforme de connexion telle qu'un compte Nintendo, un compte du Club des Dresseurs Pokémon, un compte Google, un compte Facebook ou un Identifiant Apple (la disponibilité des plateformes de connexion varie selon votre appareil).